Práce na výstavbě této farnosti začaly v roce 1247 vůlí Podestà z Massa Marittima a skončily v roce 1252. V té době to byl jediný kostel uvnitř zdí okresu Novigrad a byl postaven tak, aby vyhovoval růstu obyvatelstva. Skutečnost, že byla pověřena svobodným společníkem, naznačuje touhu prosadit svou autonomii také v církevní oblasti. Kostel měl jednu loď, střechu z vazníků a podpůrných oblouků a vykonával funkce katedrály, dokud nebyla postavena katedrála San Cerbone. V 1273 obec postoupil kostel Augustiniánského mnichy, kteří vytvořili kláštera, tam ale o dvacet let později se přenesl farnosti Nový Kostel Sant ' agostino, hned vedle dveří. Od konce osmnáctého století až do druhé poloviny osmnáctého století byla budova využívána jako klášter a později se stala domovem mateřských a základních škol. Dnes je kostel San Pietro all ' orto plní funkci sídla Terziere Novigrad, zatímco zbytek budovy sídlí Muzeum sakrálního Umění, Sbírka Současného Umění Angiolino Martini, a Muzeum Starožitných Mechanických Orgánů.