Práce na stavbe tejto farnosti sa začali v roku 1247 vôľou Podest Di Di Massa Marittima a skončili v roku 1252. V tom čase to bol jediný kostol v múroch Novigradského okresu a bol postavený tak, aby spĺňal rast obyvateľstva. Skutočnosť, že bola zadaná slobodným spoločným podnikom, naznačuje túžbu presadiť svoju autonómiu aj v cirkevnej oblasti. Kostol mal jednu loď, strechu z väzníkov a podporných oblúkov a vykonával funkcie katedrály až do vybudovania katedrály San Cerbone. V roku 1273 obec postúpila kostol Augustiniánskym mníchom, ktorí tam vytvorili kláštor, ale asi o dvadsať rokov neskôr preniesli farnosť do nového kostola Sant ' Agostino hneď vedľa. Od konca osemnásteho storočia až do druhej polovice osemnásteho storočia slúžila budova ako kláštor a neskôr sa stala domovom materských a základných škôl. Dnes kostol San Pietro all ' Orto plní funkciu sídla Terziere v Novigrade, zatiaľ čo vo zvyšku budovy sa nachádza Múzeum posvätného umenia, zbierka súčasného umenia Angiolino Martini a Múzeum starožitných mechanických orgánov.
