Istoria bisericii Santa Maria la Nova este legată de primele mișcări conventuale. Prima comunitate franciscană din Napoli (1216) s-a așezat pe ruinele unei vile romane, fondând Santa Maria ad Palatium pe locul unde se va ridica mai târziu Castel Nuovo. Când Carius I de Anjou a confiscat zona și le-a dat franciscanilor o altă bucată de teren pe care să construiască noua mănăstire, a fost construit actualul sit, care a luat numele de Santa Maria La Nova (1279).Aspectul actual al clădirii este cel din secolul al XVI-lea, fiind reconstruită de Giovanni Cola di Franco (1596-1599). Interiorul, îmbogățit în diferite momente, este dominat de tavan, un alt exemplu, după San Gregorio Armeno, de tâmplărie din lemn, sculptată și aurită, în care sunt încastrate patruzeci și șase de panouri, pictate între 1598 și 1603. Tot de pe fațadă este vizibilă și capela San Giacomo della Marca, pictată în frescă de Massimo Stanzione cu scene din viața sfântului (c. 1644-1646).Mănăstirea are un refectoriu și două cloistere, dintre care cel mai mic a fost pictat în frescă în prima jumătate a secolului al XVII-lea cu motive grotești și scene din viața Sfântului Iacob de la Marca.