La chiesa di Santa Margherita, risalente al 1032, si trova in una piccola stradina secondaria dopo la Casa di Dante, in direzione di Via del Corso. Nonostante sia conosciuta come "la chiesa di Dante" perchè era quella frequentata dalla sua famiglia e perchè fu qui che il poeta ufficializzò il suo matrimonio combinato con Gemma Donati, sembra in realtà che fosse Beatrice la vera protagonista di questo luogo. Secondo la leggenda, i resti di Beatrice si trovano proprio qui, presso la lapide della famiglia Portinari, ubicata a sinistra dell'entrata principale, ma alcuni ricercatori affermano, invece, che sia stata sepolta in Santa Croce, dato che era la chiesa a cui apparteneva la famiglia di suo marito. Tradizione vuole che i visitatori siano soliti scrivere delle lettere a Beatrice, chiedendole ed implorandola di dar loro una mano con la propria vita sentimentale, e che siano soliti lasciarle in un piccolo cesto posto vicino alla sua teca.
