De Kerk van San Giovanni Battista is een van de mooiste en best bewaarde voorbeelden van de Apulische Romaanse stijl aanwezig in Matera. De oorspronkelijke structuur dateert uit jaren vlak voor de twaalfde eeuw en werd voltooid in 1233, in deze periode stond de kerk bekend als Santa Maria la Nova en was een plaats van ontvangst voor de augustijnse boetelingen van Accon. Toen de nonnen verhuisden, rond het einde van de vijftiende eeuw, werd de kerk verlaten en bleef ongebruikt tot 1695 jaar waarin Monseigneur Del Ryos haar heropening tot aanbidding goedkeurde, met de naam waaronder we haar nu kennen. Het is toegankelijk via wat oorspronkelijk de zij gevel was, het belangrijkste werd opgenomen in 1610 in de bouw van het aangrenzende gebouw dat de functie van nosocomio moest uitvoeren. Het mooie portaal, een rozenraam versierd met verfijnde ornamenten en een standbeeld van St.Johannes de Doper gemaakt van polychroom steen vallen op. Rechts van het portaal heeft de gevel die overeenkomt met de apse een structuur die zeer dicht bij de oorspronkelijke staat. Het element dat het meest kenmerkend is voor deze kerk is de typisch middeleeuwse interne architectuur, is het mogelijk om te bewonderen dankzij het initiatief van Abt Marcello Morelli die tussen 1920 en 1930 besloten om de achttiende-eeuwse cover te elimineren. De kerk heeft een Latijns kruis en bestaat uit 3 naven gedeeld door vierkanten pilaren; op hen staan halve kolommen en kapitalen met zeer uitgebreide en zeer gevarieerde decoraties. Uit de pilaren ontstaan grote bogen die kruiskasten vormen.
