L'abbaye de Vallingegno est située au sommet d'une colline à quelques kilomètres de Gubbio, dans la belle nature de la campagne ombrienne. La date exacte de sa fondation est inconnue, mais l'abbaye est mentionnée dans la "Legenda Sancti Verecundi" qui date du 7e siècle et raconte le martyre d'un jeune chevalier qui s'est converti à la foi chrétienne.
L'abbaye, qui a peut-être été à l'origine un temple du dieu païen Genio - d'où le nom latin Vallis Genii - a été occupée par des moines bénédictins pendant près de quatre siècles, et est restée un centre florissant jusqu'à sa suppression, vers 1442.
Le complexe actuel est composé de l'église, du monastère et d'un clocher-pignon en briques.
L'intérieur de l'église à nef unique conserve encore des traces des structures précédentes, notamment dans la crypte à plan carré qui abrite des chapiteaux de colonnes sculptés selon des styles antérieurs au XIe siècle. La voûte d'arête de la crypte est renforcée par un pilier central. De nombreux épisodes de la vie de saint François sont liés à l'abbaye. Les biographes du saint racontent, par exemple, comment François s'y réfugia après avoir été attaqué près de Caprignone ; le prieur, cependant, ne le reçut pas bien, et le saint fut chargé de tâches ménagères modestes. Des années plus tard, le prieur de l'abbaye revint vers François pour le supplier de lui pardonner ;