Chiesa di San Francesco foi fundada em meados dos anos 200 por San Francesco, que naqueles anos ficou em Massa Marittima para promover a formação de um primeiro núcleo de Frades da ordem. A estrutura da Igreja, ligada a um convento, é extremamente simples, em estilo gótico, com uma única nave e arcos de apoio ogival e foi originalmente localizado dentro das muralhas da cidade. O exterior foi caracterizado por grandes janelas pontiagudas. A igreja passou por muitas renovações, principalmente devido a subsídios devido a terremotos, e a nave foi reduzida em 1529 e várias vezes nos séculos XVIII e XIX. Hoje em dia, da estrutura original, apenas uma parte da ABSIDE e parte da nave permanecem, enquanto lá dentro está o Túmulo de Bindoccio, filho de Margherita Aldobrandeschi e Nello Pannocchieschi (casou-se em primeiro casamento para a PIA Dei Tolomei). Algumas pinturas do século XVII de Raphael Vanni estão localizadas perto dos três altares.