História kostola Panny Márie na moste je úzko spätá s mostom, resp. s mostmi, na ktorých je postavený.
Na moste známom ako Diokleciánov most postavili občania v roku 1389 prvé oratórium - najprv zasvätené Panne Márii z mosta a potom Panne Márii Milostivej -, ktoré bolo potrebné na ochranu antickej sochy nájdenej v mostných rozpätiach po zemetrasení v roku 1088. Tradícia, ktorá sa nepotvrdila, hovorí, že socha Madony s dieťaťom pochádzala z 8. storočia a bola byzantskej výroby a že ju ukryli v moste, aby ju uchránili pred ikonoklastickou zúrivosťou, ktorá v tých rokoch zúrila.Pravdepodobnejšie je, ako uvádza historik Antinori, že v starobylej kaplnke bol len maľovaný obraz Panny Márie a súčasná terakotová socha pochádza z konca 14. storočia. Prvé oratórium, ktoré stálo na mieste dnešnej Kaplnky Najsvätejšej sviatosti, obsahovalo sošku Madony, ktorú obklopovali postavy dvanástich apoštolov. Práve toto umiestnenie medzi postavy v plnej dĺžke viedlo k dokončeniu mariánskeho artefaktu, ktorý bol pôvodne polovičný. Následné rozšírenie oratória, ktoré bolo potrebné kvôli rastúcemu počtu veriacich, ktorí sa obracali k Panne Márii z mosta a získavali od nej hojné milosti, viedlo v neskorších etapách k výstavbe baziliky v jej súčasnej podobe, ktorá sa uskutočnila koncom 18. storočia, navrhol architekt Eugenio Micchitelli po zbúraní inej bohoslužobnej budovy, kostola Santissima Annunziata, prvej katedrály v meste po tom, ako bolo Lanciano vyhlásené najprv za biskupské sídlo (1515) a potom za arcibiskupstvo (1562).
Fasáda, na ktorej sa začalo pracovať v roku 1819, nebola nikdy dokončená. Má prednú časť, ktorú tvorí trojsvetlíkový portikus so stĺpmi zakončený balustrádou terasy. Jeho murivo je z lícových tehál a je jedným z najlepších príkladov použitia terakoty v architektúre.
Impozantnú štvorposchodovú zvonicu (vrátane tej, ktorá je dnes zasypaná kvôli zvýšeniu a vyrovnaniu námestia) postavil v rokoch 1610 až 1640 Tommaso Sotardo z Milána. Konsolidačné práce na stavbe sa uskutočnili v rokoch 1942-43 a nedávno v rokoch 1985-1996 počas jej uzavretia po zemetrasení.