Rocca Paolina udgør i dag en sand "by i byen" i Perugia. Det blev bygget på foranledning af pave Paul III Farnese med henblik på at omdanne Perugia til et befæstet citadel efter at have erobret byen for at annektere den til pavestaten mod indbyggernes ønske. For at bygge sin fæstning fik pave Paul III. nedrevet hundredvis af huse, kirker og klostre, hvilket gav ham et evigt had fra perugianerne, som angreb og beskadigede Rocca mere end én gang i løbet af århundrederne. Befæstningen blev endelig ødelagt i 1860 efter mere end 300 års (ikke alt for) hæderlig tjeneste.Der er i dag kun små fragmenter tilbage af hele fæstningen, som ofte bruges til kulturelle arrangementer og markeder, og som stadig indeholder Baglioni-familiens gamle huse. Sidstnævnte var bitre fjender af pave Paul III, og mange af de kvarterer og bygninger, der blev ødelagt af paven, tilhørte netop denne familie. Et kuriosum: Porta Marzia, en af de ældste byporte, stammer tilbage fra etruskisk tid, men lå oprindeligt ikke hvor den ligger i dag. Da arkitekten Antonio da Sangallo den Yngre fik ordre til at indlemme den i Rocca Paolina-murene, fik han den bogstaveligt talt skilt ad og samlet igen fire meter længere fremme, så den passede perfekt ind i de nye murers udformning.