Un premier noyau du Museo Teatrale alla Scala a été créé en 1911 avec l'achat aux enchères parisiennes de la collection privée de l'antiquaire parisien Giulio Sambon, grand amateur de théâtre. L'achat a été rendu possible grâce à une souscription publique et à une allocation du gouvernement. La collection devait documenter l'histoire du spectacle depuis l'antiquité jusqu'à nos jours, initialement sans aucun rapport avec l'activité spécifique du théâtre de la Scala. Le musée a été officiellement ouvert le 8 mars 1913.
Dans les années qui ont suivi, de nombreux dons et acquisitions sont venus s'ajouter au noyau initial de la collection. Pendant la Seconde Guerre mondiale, les collections ont été déplacées dans des lieux sûrs pour être conservées. À la fin de la guerre, après la reconstruction, le musée a été réorganisé par Fernanda Wittgens. L'espace d'exposition du musée se compose de 14 salles et présente les bustes en marbre et les portraits de nombreux compositeurs, chefs d'orchestre et artistes de la scène musicale européenne des deux derniers siècles, ainsi que des instruments de musique anciens. Certains tableaux représentent le Teatro alla Scala. Un tableau d'Angelo Inganni représente la façade de la Scala en 1852, alors que l'entrée du théâtre était encore proche des bâtiments et que la place devant n'avait pas encore été ouverte.
La section des archives de la bibliothèque conserve d'importantes collections de décors, de croquis de théâtre, d'otographies, d'affiches et d'affiches, de livrets d'opéra, de lettres d'acteurs, de metteurs en scène, de compositeurs et de chanteurs qui ont collaboré avec le Teatro alla Scala du XVIIe siècle à nos jours. Il existe également de nombreuses partitions musicales manuscrites de Giuseppe Verdi, Gioachino Rossini, Giacomo Puccini et Gaetano Donizetti. Il existe également des manuscrits musicaux d'opéras complets, notamment la Messe de Requiem de Giuseppe Verdi et la Tancrède de Gioachino Rossini.