Historien om kirken Santa Maria la Nova er knyttet til de første klosterbevægelser. Det første franciskanersamfund i Napoli (1216) slog sig ned på ruinerne af en romersk villa og grundlagde Santa Maria ad Palatium på det sted, hvor Castel Nuovo senere skulle opføres. Da Carius I af Anjou konfiskerede området og gav franciskanerne et andet stykke jord, som de kunne bygge det nye kloster på, blev det nuværende sted bygget og fik navnet Santa Maria La Nova (1279).Bygningen har i dag et udseende fra det 16. århundrede, idet den er blevet genopbygget af Giovanni Cola di Franco (1596-1599). Interiøret, der er blevet beriget på forskellige tidspunkter, domineres af loftet, som er et andet eksempel efter San Gregorio Armeno på træ-, udskårne og forgyldte snedkerarbejder, hvor der er indlejret 46 paneler, malet fra 1598 til 1603. Fra facaden kan man også se San Giacomo della Marca-kapellet, som er udsmykket af Massimo Stanzione med scener fra helgenens liv (ca. 1644-1646).Klostret har et refektorium og to korsgange, hvoraf den mindste blev udsmykket i første halvdel af det 17. århundrede med groteske motiver og scener fra Sankt Jakob af Marche's liv.