El 31 de mayo de 2009 se abrió al público el nuevo Museo Arqueológico en la iglesia basílica de San Lorenzo y en la adyacente capilla Meli del siglo XV. Constituye el desarrollo de la antigua Sección Arqueológica del Museo Cívico, cerrada desde finales de los años 90 para permitir la restauración de algunos tipos de materiales - en particular los mosaicos - y completa la exposición, todavía en el Palacio Affaitati, de las colecciones de formación "histórica" no territorial, a partir del legado del marqués Ala Ponzone.
La iglesia de San Lorenzo, desconsagrada a finales del siglo XVIII, con planta basilical de tres naves, data de finales del siglo XII - principios del XIII y tiene las características peculiares de la arquitectura románica.
Las excavaciones realizadas desde 1962 han sacado a la luz los restos de una iglesia anterior, identificable con la mencionada en un pergamino del 990, de un edificio de cementerio paleocristiano y de una necrópolis romana del siglo I a.C., situada en el primer tramo suburbano, hacia el este, de la antigua Vía Postumia.
El uso del complejo monumental como museo, en sí mismo un sitio arqueológico, ha favorecido su completa recuperación, tanto desde el punto de vista estructural como decorativo, aunque todavía se conserva.
En la actualidad, alberga lo que puede considerarse el corazón de las colecciones arqueológicas de Cremona: a través de los hallazgos encontrados desde el siglo XIX hasta la reciente excavación de la Piazza Marconi, se restaura la imagen de la ciudad fundada por los romanos en el año 218 a.C., la primera al norte del Po.