Katedrala Altamura, jedna od rijetkih svetih građevina namijenjenih Friedrichu, nije ih vidjela. Prvi kamen položen je 1232. godine istodobno s gradskom bazom; izgradnja crkve bila je vrlo spora, a tek u trinaestom stoljeću, više od pedeset godina nakon smrti cara, mogao se pohvaliti veličanstvenim portalom, jednim od najljepših u Pugliji. Zamišljao ju je kao arhitektonski "unicum", u usporedbi s Castel del Monte. Učinio je "Unicum" čak i iz pravne perspektive jer ju je oslobodio od bilo koje biskupske jurisdikcije; on ju je, zapravo, preuzeo na vlast biskupa susjednog šljunka i stavio ga u svoje izravne ovisnosti poput kapele Palatine, to jest u vlasništvu kraljevske palače.
