Crkva je imala burnu povijest. 512. godine nove ere Saint-Germain, koji je kasnije postao pariški biskup, uvjerio je merovinškog kralja Hildeberta da sagradi Opatiju s Crkvom. Crkva u kojoj su se nalazile važne relikvije bila je posvećena Svetom Vincentu i svetom križu. Bila je to jedna od najvažnijih crkava u Francuskoj i posljednje počivalište kraljeva dinastije Merovingian. Krov mu je bio obojan u zlato, što je dovelo do imena "Saint-Germain-le-Dore" (pozlaćeni Saint-Germain). U devetom stoljeću Vikinzi su nekoliko puta opljačkali crkvu i na kraju je uništena vatrom. Oko 1000.započela je obnova crkve i na kraju je posvećena 1163. Tijekom kasnog srednjeg vijeka u kompleksu benediktinske opatije podignut je niz dodatnih zgrada koje su se razvile u jednu od najvećih i najvažnijih u cijeloj Francuskoj.
Tijekom Francuske revolucije vjerski su redovi potisnuti, a Opatija je korištena kao skladište. Snažna eksplozija baruta pohranjenog u trpezariji uništila je gotovo cijeli kompleks i ozbiljno oštetila crkvu.
Crkva danas Sadašnji izgled crkve rezultat je obnove u devetnaestom stoljeću, kada su od arhitekta Victora Baltara i slikara Jean-Hipolita Flandrena zatraženi da crkvu vrate u prijašnji sjaj.
Vanjski dio crkve definiran je čvrstim zvonikom, jednim od najstarijih u cijeloj Francuskoj. Još dvije kule izgrađene s obje strane transepta nisu preživjele doba revolucije. Unutrašnjost prikazuje mješavinu različitih arhitektonskih stilova, rezultat kontinuirane gradnje kroz stoljeća. Izvorni stupovi iz šestog stoljeća podupiru zbor iz dvanaestog stoljeća; romanički lukovi kombiniraju se s gotičkim svodovima, a postoje čak i barokni elementi. U crkvenim kapelama nalazi se nekoliko zanimljivih grobnica, uključujući one filozofa Renea Descartesa i Ivana EINSUSA Casimira Vase, koji je bio poljski kralj u sedamnaestom stoljeću, sve dok nije postao opat opatije Saint-Germain-de-pre.
Četvrt Saint-Germain-de-pre Crkva je svoje ime dala četvrti Saint-Germain-de-pre, živahnoj četvrti u šestom okrugu koja je svoju reputaciju književne četvrti stekla u dvadesetom stoljeću, kada su se pisci, intelektualci i filozofi sastali u jednom od mnogih kafića. Filozof Jean-Paul Sartre i Simone de Beauvoir često su se sastajali u "kafiću flor", A Ernest Heminguei bio je čest posjetitelj u"Noinsusu".
