Museet i San Gimignano ligger i det gamle kloster Santa Chiara, som tidligere blev brugt som udestue for unge damer af gode familier og senere som mellemskole. Komplekset gennemgik restaureringsarbejde mellem 1980'erne og 1990'erne, hvilket gjorde det til et udstillingscenter af stor interesse. Inde i museet er der flere sektioner, herunder det arkæologiske museum, Santa Fina Spezieria og "Raffaele De Grada" Modern and Contemporary Art Gallery.Det arkæologiske museum i San Gimignano rummer vigtige vidnesbyrd, der fortæller San Gimignanos ældste historie, fra den arkaiske etruskiske æra op til det attende århundrede. Udstillingen er opdelt i to sektioner: en dedikeret til etruskisk og romersk kunst, med fund fra bosættelser og nekropoler i området, der dateres tilbage til det 7.-1. århundrede f.Kr.; den anden afdeling er dedikeret til håndværksmæssige produktive aktiviteter, såsom glas og keramik, som var til stede i byen i middelalderen.Spezieria di Santa Fina er annekteret til hospitalet af samme navn, grundlagt i midten af det 13. århundrede. Udstillingen præsenterer inventar og inventar fra de gamle sundhedsinstitutioner i byen. Layoutet genskaber miljøet og de originale aromaer fra apoteket, et af de ældste i Toscana. Produkterne var indeholdt i keramik- og glasbeholdere af høj kvalitet, der stammer fra det 15. til det 18. århundrede. Udstillingsrejseplanen sporer medicinens historie og aktiviteterne i forbindelse med apotekets arbejde. En række ældgamle lægemidler er også udstillet, såsom skorpions olie og de komponenter, der bruges til fremstilling af lægemidler.Galleriet for moderne og moderne kunst "Raffaele De Grada" er opkaldt efter den kendte milanesiske maler Raffaele De Grada. Kunstneren valgte San Gimignano som sit foretrukne hjem efter at have rejst rundt i Europa. Galleriet udstiller mange værker af De Grada og andre kunstnere fra det 19. og 20. århundrede. Den permanente samling omfatter værker fra det toscanske 19. århundrede og det 20. århundrede. Der er også to monografiske rum dedikeret til Niccolò Cannicci og Raffaele De Grada, samt værker af Giannetto Fieschi. Galleriet er også beriget med italienske malerier fra 1930'erne til 1980'erne fra Pacchiani Collection.Gallery of Modern and Contemporary Art repræsenterer det vigtigste udstillingssted i San Gimignano, hvor der arrangeres hyppige midlertidige udstillinger dedikeret til 19., 20. og samtidskunst.