Santa Maria la Nova kiriku ajalugu on seotud esimeste kloostriliikumistega. Esimene frantsiskaani kogukond Napolis (1216) asus Rooma villa varemetele, asutades Santa Maria ad Palatiumi kohas, kuhu hiljem kerkis Castel Nuovo. Kui Carius I Anjou konfiskeeris ala ja andis frantsiskaanidele teise maatüki, millele ehitada uus klooster, ehitati praegune koht, mis sai nimeks Santa Maria La Nova (1279).Hoone praegune välimus on 16. sajandist, mille ehitas ümber Giovanni Cola di Franco (1596-1599). Eri aegadel rikastatud interjööris domineerib lagi, mis on San Gregorio Armeno järel veel üks näide puust, nikerdatud ja kullatud tisleritööde kohta, millesse on põimitud nelikümmend kuus aastatel 1598-1603 maalitud tahvlit. Fassaadilt on nähtav ka San Giacomo della Marca kabel, mille Massimo Stanzione (u. 1644-1646) freskod on maalinud pühaku elustseenidega.Kloostris on refektoorium ja kaks kloostrit, millest väiksem on 17. sajandi esimesel poolel freskodeeritud grotesksete motiividega ja stseenidega Püha Jaakobuse Martsi elust.
