I 1335 opførte Bartolomeo di Giacomo de tre første etager af klokketårnet, som blev færdiggjort i 1498 af Antonio da Lodi, der byggede tårnets klokketårn og dets kroning i form af et ottekantet tempel. Mellem slutningen af det 16. og begyndelsen af det 17. århundrede restaurerede ærkebiskop Matteo Saminiato kirken og fik i 1599 udført døbefonten af porfyr fra Verona. I 1703 fik et ødelæggende jordskælv klokketårnets tårnspir til at styrte sammen. Mellem 1764 og 1770 omdannede ærkebiskop Francesco Brancia kirken fuldstændigt og gav den sit nuværende udseende. Udsmykningen af hvælvingen blev udført i midten af det 19. århundrede af den lokale kunstner Del Zoppo.I det 20. århundrede udførte arkitekten Guido Cirilli et "design i stil" af hele det religiøse kompleks. Den første fase af indgrebet, i 1910'erne, omfattede hovedsagelig isolering af klokketårnet og dets konsolidering. Derefter skabte han en beklædning af bygningen ved at omslutte den med en muret indhegning, der ikke lod nogen af delene fra den tidligere konstruktion være synlige. Han forenede katedralens krop med klokketårnet ved at designe en portal med gavl, over hvilken facadens forside hæver sig op. Han integrerede klokketårnet med genopbygningen af spiret. Mellem 1970 og 1976 blev der udført restaurerings- og konsolideringsarbejder på hele bygningen, hvor den tidlige middelalderlige struktur i krypten blev afdækket og barokudsmykningen ødelagt takket være den daværende overinspektør Mario Moretti.I præstegården og sekretariatet er der fine malerier af Saverio Persico, en strålende efterfølger af den neapolitanske maler Francesco Solimena fra det 18. århundrede. Hovedaltertavlen i præstegården forestiller den hellige Thomas' ufattelighed, mens malerierne i sekretariatet er "Fodvaskningen" og "Det sidste måltid". Et Persico-lærred findes også i Kapellet for den ubesmittede undfangelse, der er bestilt af ærkebiskop Nicola Sanchez de Luna (alteret til venstre for tværskibet). Det er også interessant at se en anden af Solimenas elever: Ludovico de Majo, hvis lærred findes i kapellet tilegnet San Gaetano (alteret til højre for tværskibet). Værd at bemærke er det værdifulde trækor, der blev udført i 1769 af Ferdinado Mosca, den største snedker i Abruzzo .Krypten i San Giustino-katedralen har en uregelmæssig grundplan, der er opdelt i seks små skibe med hver to fag. I dag ser den ud til at være lavet udelukkende af mursten med stenelementer kun i søjlekapitæler og pilastre med bundtede pilastre. I krypten er der bevaret fragmenter af fresker fra det 14. og 15. århundrede og en marmorark med relikvierne af Sankt Justin, Chietis skytshelgen og byens første biskop, som blev skulptureret i 1432 af biskop Marino del Tocco.Det nuværende billede af krypten er resultatet af en restaurering, der blev udført mellem 1970 og 1976, hvor den tidlige middelalderlige struktur blev bragt frem i lyset ved at ødelægge barokudsmykningen, takket være den daværende inspektør Mario Moretti. Moretti fik fjernet alle barokke stukkaturdekorationer for at genskabe bygningens tidligere middelalderlige indretning.Ved siden af krypten ligger ærkebroderskabets kapel for De Dødes Hellige Bjerg, et bemærkelsesværdigt eksempel på barokken med storslået forgyldt stukkatur, der er smedet af den lombardiske stukkatør Giovan Battista Giani, en mester i meget fint håndværk og af stor betydning for denne type udsmykning i vores region. Hele udsmykningen af kapellet er meget symbolsk og understreger ærkebroderskabets arbejde. Den kostbare altertavle er et værk af Paolo De Mattheis, en kunstner fra den neapolitanske skole Solimena, og forestiller en Sancta Maria succurre miseris, gengivet med rigelige draperinger og kostbare pastelfarver. Bemærk det velsignende barn, der står på en pude på jomfruens ben, og som vender sit blik og dermed sin velsignelse mod tilskueren, mens Madonnaen vender sig mod sjælene nedenunder.Kapellet tilhører stadig ærkebroderskabet for den hellige dødes bjerg i Chieti, en vigtig og meget gammel kongregation, der passer og vogter ritualerne i forbindelse med langfredagsprocessionen.