Kirken museum of San Francesco, bygget til de mindre munke mellem 1335 og 1338. Museet er indrettet i tre udstillingssteder: ex-kirke, der er kendt verden over for fresco cyklus malet af Benozzo Gozzoli mellem 1450 og 1452, der skildrer Livet i Saint Francis, og hvor der også vises en Natività af Perugino (begyndelsen af 16-tallet), og fresker af den Umbriske skole; den Kunst Galleri med værker af Francesco Melanzio, Antoniazzo Romano og den Umbriske skole fra 1300-tallet til 1700-tallet; og krypten, med arkæologiske fund, skulpturer og stykker fra forskellige tidsaldre