Το μοναστήρι του San Domenico Maggiore, το οποίο σχηματίζει ένα συγκρότημα μεγαλοπρεπών αναλογιών με την εκκλησία, είναι το αποτέλεσμα αιώνων διαστρωμάτωσης που ξεκίνησε το 1227, όταν ο Πάπας Γρηγόριος Θ' έστειλε μια μικρή ομάδα Δομινικανών στη Νάπολη, οι οποίοι εγκαταστάθηκαν στο αρχαίο μοναστήρι του San Michele Arcangelo στη Morfisa. Ο Θωμάς Ακινάτης έμεινε στο μοναστήρι μεταξύ 1272 και 1274 και δίδαξε θεολογία στο Studium που ίδρυσε εκεί ο Κάρολος Α΄ του Ανζού. Το 1289 άρχισαν οι εργασίες ανακαίνισης του μοναστηριού. Ο οργανισμός, ο οποίος με την πάροδο των αιώνων επεκτάθηκε σταδιακά σε μια insula σχεδόν τετραπλάσια σε μέγεθος από το πλέγμα της αρχαίας πόλης, η οποία συγκρίνεται από τους επισκέπτες με την πάροδο του χρόνου με μια πραγματική πόλη μέσα στην πόλη, έφτασε στο αποκορύφωμά του μετά τα έργα που προώθησε από το 1669 και μετά ο ηγούμενος Tommaso Ruffo των δούκων της Bagnara.Ο ηγούμενος Ruffo, ο οποίος διέθεσε μεγάλο μέρος της προσωπικής του περιουσίας για το έργο, θέλησε να διαφυλάξει ορισμένα δωμάτια που συνδέονται με την μακραίωνη ιστορία του συγκροτήματος, όπως το κελί του Αγίου Θωμά. Το αποτέλεσμα των εργασιών που συνεχίστηκαν καθ' όλη τη διάρκεια του 17ου αιώνα ήταν ένα κτίριο μεγαλοπρεπών αναλογιών, χωρισμένο σε τρία σκέλη: τον κοιτώνα του Αγίου Θωμά, το δόκιμο και τον κοιτώνα των δασκάλων, διατεταγμένα γύρω από έναν ανοιχτό χώρο που ορίστηκε ως κήπος. Δίπλα στον κοιτώνα του Αγίου Θωμά υπήρχαν το Refectory, το Chapter House και η βιβλιοθήκη στον πρώτο όροφο. Οι αρχιτέκτονες Bonaventura Presti, Francesco Antonio Picchiatti και Luigi Nauclerio εναλλάχθηκαν σε αυτό το μνημειώδες εγχείρημα. Σήμερα, το μοναστήρι είναι διαμελισμένο σε διάφορους χώρους: ένα τμήμα χρησιμοποιείται από τους Δομινικανούς, ένας χώρος στο επίπεδο του μοναστηριού καταλαμβάνεται από το γυμναστήριο Virtus, ένας άλλος καταλαμβάνεται σε τρία επίπεδα από το σχολικό ινστιτούτο Casanova, και τέλος το σημαντικότερο τμήμα, που στέγαζε τις αίθουσες διδασκαλίας του πρώην Ειρηνοδικείου μέχρι τη δεκαετία του 1990, αποτελεί αντικείμενο των σημερινών εργασιών αποκατάστασης.Η αποκατάσταση αυτών των μεγάλων χώρων, που στέγαζαν τα κελιά ασφαλείας καθώς και τις αίθουσες του Δικαστηρίου, με τη συνεπακόλουθη δημιουργία ημιωρόφων, ψευδοροφών και αταίριαστων κτιριακών στοιχείων, είχε ως στόχο την ανασύσταση των αρχικών αρχιτεκτονικών και χωροταξικών χαρακτηριστικών και την αποκατάσταση των συνδέσεων μεταξύ των χώρων και των τυπολογικών χαρακτηριστικών τους. Σημαντικό μέρος της παρέμβασης αφορούσε το διακοσμητικό "δέρμα" αυτών των μνημειακών χώρων με την αποκατάσταση των σωζόμενων εικονογραφικών κύκλων, των γυψοσανίδων του τέλους του 17ου αιώνα και του κελιού του Αγίου Θωμά, που διακοσμήθηκε εξ ολοκλήρου τη δεκαετία του 1720, καθώς και πολυάριθμων επίπλων, μεταξύ των οποίων και η λειτουργική μηχανή για τις καραντίνες, ένας σύνθετος οργανισμός που μπορεί να αποτελέσει ένα από τα πιο ελκυστικά σημεία της μελλοντικής μουσειακής οργάνωσης των χώρων αυτών. Το έργο, το οποίο αφορούσε μια τεράστια έκταση περίπου 7.000 τετραγωνικών μέτρων, συμπεριλαμβανομένων 4.000 τετραγωνικών μέτρων του πρώην Ειρηνοδικείου, πλήρως ανακαινισμένου και επαναλειτουργικού, και 3.000 τετραγωνικών μέτρων της πτέρυγας του Ινστιτούτου A Casanova, αποκλειστικά ενοποιημένου, αφορούσε μια μεγάλη ομάδα εργασίας από την Προϊσταμένη Αρχή Αρχιτεκτονικής Κληρονομιάς της Νάπολης και της επαρχίας της, με τη συμβολή της εμπειρίας εξειδικευμένων εξωτερικών συμβούλων, για μεγάλο χρονικό διάστημα, το οποίο διακόπηκε από δύο διαδοχικές παρτίδες εργασίας που ξεκίνησαν το 2000.Η πρώτη παρτίδα, που ξεκίνησε το 2000 και ολοκληρώθηκε το 2002, ήταν μέρος του προγράμματος Polis - Musea, το οποίο προωθήθηκε από την ίδια Υπερεπιθεώρηση για την αξιοποίηση των ιστορικών κτιρίων της Νάπολης με συγχρηματοδότηση από την Ευρωπαϊκή Κοινότητα στο πλαίσιο των κονδυλίων του ΕΤΠΑ για το έργο "Global Grant Ancient Centre of Naples". Η δεύτερη παρτίδα, που ξεκίνησε τον Μάιο του 2006 και ολοκληρώθηκε τον Ιούλιο του 2011, χρηματοδοτήθηκε χάρη στο νόμο αριθ. 400, άρθρο 1 "Παρεμβάσεις στην πολιτιστική κληρονομιά" της 20.12.2000, μετά τη συμφωνία-πλαίσιο προγράμματος μεταξύ του Υπουργείου Πολιτιστικής Κληρονομιάς και Δραστηριοτήτων και της Περιφέρειας Καμπανίας.Η Μονή επαναλειτούργησε για το κοινό τον Μάιο του 2012 χάρη στην κοινή δέσμευση των τοπικών και κεντρικών φορέων.