Η ιστορία της εκκλησίας της Παναγίας της Γέφυρας είναι στενά συνδεδεμένη με τη γέφυρα, ή μάλλον με τις γέφυρες πάνω στις οποίες είναι χτισμένη.
Η κατασκευή στη γέφυρα που είναι γνωστή ως Γέφυρα του Διοκλητιανού του πρώτου ορατορίου - αρχικά αφιερωμένου στην Παναγία της Γέφυρας και στη συνέχεια στην Παναγία των Χαρίτων - από τους πολίτες το 1389, ήταν απαραίτητη για να φυλάξουν ένα αρχαίο άγαλμα που βρέθηκε στα ανοίγματα της γέφυρας μετά το σεισμό του 1088. Η παράδοση, η οποία δεν έχει επιβεβαιωθεί, αναφέρει ότι το άγαλμα της Παναγίας και του Παιδιού ήταν του 8ου αιώνα και βυζαντινής κατασκευής και ότι είχε κρυφτεί στη γέφυρα για να σωθεί από την εικονοκλαστική μανία που μαινόταν εκείνα τα χρόνια.Πιο πιθανό, όπως αναφέρει ο ιστορικός Antinori, το αρχαίο παρεκκλήσι περιείχε μόνο μια ζωγραφισμένη εικόνα της Παναγίας και το σημερινό γλυπτό από τερακότα χρονολογείται στα τέλη του 14ου αιώνα. Το πρώτο ορατόριο, το οποίο βρισκόταν στο σημερινό παρεκκλήσι του Ευλογημένου Μυστηρίου, περιείχε το αγαλματίδιο της Παναγίας πλαισιωμένο από τις μορφές των δώδεκα αποστόλων. Ακριβώς αυτή η τοποθέτηση, ανάμεσα σε ολόσωμες μορφές, οδήγησε στην ολοκλήρωση του αρχικώς ημίμετρου τεχνουργήματος της Μαρίας. Οι μεταγενέστερες επεκτάσεις του στομίου, αναγκαίες λόγω του αυξανόμενου αριθμού των πιστών που στρέφονταν στην Παναγία της Γέφυρας και λάμβαναν άφθονες χάρες από αυτήν, οδήγησαν σε μεταγενέστερα στάδια στην οικοδόμηση της Βασιλικής στη σημερινή της μορφή, η οποία πραγματοποιήθηκε στα τέλη του 18ου αιώνα, σχεδιάστηκε από τον αρχιτέκτονα Eugenio Micchitelli, αφού κατεδαφίστηκε ένα άλλο κτίριο λατρείας, η εκκλησία της Santissima Annunziata, ο πρώτος καθεδρικός ναός της πόλης μετά την ανέγερση του Lanciano αρχικά ως επισκοπικής έδρας (1515) και στη συνέχεια ως αρχιεπισκοπής (1562).
Η πρόσοψη, οι εργασίες για την οποία ξεκίνησαν το 1819, δεν ολοκληρώθηκε ποτέ. Διαθέτει ένα μπροστινό μέρος που αποτελείται από μια τρίφωτη στοά με κίονες που επιστέφεται από το κιγκλίδωμα μιας βεράντας. Η τοιχοποιία του είναι από οπτόπλινθους και αποτελεί ένα από τα καλύτερα παραδείγματα εφαρμογής της τερακότας στην αρχιτεκτονική τάξη.
Το επιβλητικό τετραώροφο καμπαναριό (συμπεριλαμβανομένου και αυτού που τώρα είναι θαμμένο λόγω της ανύψωσης και ισοπέδωσης της πλατείας) χτίστηκε μεταξύ 1610 και 1640 από τον Tommaso Sotardo του Μιλάνου. Εργασίες εξυγίανσης της δομής πραγματοποιήθηκαν το 1942-43 και, πιο πρόσφατα, κατά την περίοδο 1985-1996, κατά τη διάρκεια του κλεισίματος μετά από σεισμό.