Манастирът "Сан Доменико Маджоре", който заедно с църквата образува грандиозен комплекс, е резултат от многовековно разслояване, започнало през 1227 г., когато папа Григорий IX изпраща в Неапол малка група доминиканци, които се заселват в древния манастир "Сан Микеле Арканджело" в Морфиса. Тома Аквински пребивава в манастира между 1272 и 1274 г. и преподава теология в Студията, създадена там от Карл I Анжуйски. През 1289 г. започват ремонтни дейности на манастира. Организацията, която през вековете постепенно се разраства в инсула, почти четири пъти по-голяма от мрежата на древния град, сравнявана от посетителите с течение на времето с истински град в града, достига своя връх след работите, насърчавани от 1669 г. нататък от приора Томазо Руфо от рода на херцозите на Баняра.Приор Руфо, който изразходва голяма част от личното си наследство за работата, иска да запази някои помещения, свързани с многовековната история на комплекса, като например килията на Свети Тома. Резултатът от работата, продължила през целия XVII в., е сграда с величествени размери, разделена на три ръкава: общежитието на свети Тома, послушницата и общежитието на майсторите, разположени около открита площ, определена като градина. В съседство с общежитието "Свети Тома" се намирали трапезарията, капитуларията и библиотеката на първия етаж. В това монументално начинание се редуват архитектите Бонавентура Прести, Франческо Антонио Пикиати и Луиджи Науклерио. Днес манастирът е разчленен на няколко части: една част се използва от доминиканците, една площ на нивото на манастира е заета от гимназията Virtus, друга е заета на три нива от училищния институт Casanova и накрая най-важната част, в която до 90-те години на ХХ век са се помещавали класните стаи на бившия Апелативен съд, е обект на настоящите реставрационни работи.Реставрацията на тези големи пространства, в които са се помещавали охранителните камери, както и съдебните зали, с последващото създаване на мецанин, окачени тавани и несъответстващи на изискванията строителни елементи, има за цел да възстанови първоначалните архитектурни и пространствени характеристики и да възстанови връзките между помещенията и техните типологични особености. Значителна част от интервенцията се отнасяше до декоративната "кожа" на тези монументални пространства, като бяха реставрирани запазените живописни цикли, мазилките от края на XVII в. и килията "Свети Тома", изцяло декорирана през 20-те години на XVII в., както и множество мебели, включително литургичната машина за карантините - сложен организъм, който може да представлява една от най-привлекателните точки на бъдещата музейна организация на тези пространства. Проектът, който включваше огромна площ от приблизително 7000 квадратни метра, включително 4000 квадратни метра от бившия Съдебен дворец, напълно реставриран и рефункционализиран, и 3000 квадратни метра от крилото на Института "А Казанова", изцяло консолидирано, включваше голяма работна група от Надзорния съвет за архитектурно наследство на Неапол и неговата провинция, с приноса на опита на квалифицирани външни консултанти, в продължение на дълъг период от време, прекъснат от две последователни работни партиди, започващи през 2000 г.Първият лот, започнал през 2000 г. и завършил през 2002 г., беше част от програмата "Полис - Музея", насърчавана от същата тази суперинтендантска служба за валоризация на историческите неаполитански сгради със съфинансиране от Европейската общност по линия на ЕФРР в рамките на проекта "Глобален грант Античен център Неапол". Вторият лот, започнал през май 2006 г. и завършил през юли 2011 г., е финансиран благодарение на Закон № 400, чл. 1 "Интервенции в областта на културното наследство" от 20.12.2000 г., в резултат на Рамково програмно споразумение между Министерството на културното наследство и дейностите и регион Кампания.Манастирът е отворен отново за посетители през май 2012 г. благодарение на общия ангажимент на местните и централните институции.
