כנסיית סן מטאו, אשר הדוריה בנתה כקפלה אצילית משלהם, משקיפה על הכיכר סן מטאו הקטנה בגנואה.עם שיפוץ המאה השש עשרה, הפנים, עם שלושה naves, איבד כמעט לחלוטין את אופיו הגותי המקורי, אשר רק ארבע קשתות ogival בבסיס הכיפה להישאר, נתמך על ידי שני עמודים לכיוון הפרסביטרי ושני עמודים לכיוון Naves. הספינה הראשית מופרדת מן אלה לרוחב על ידי עמודות. המקהלה, המזבח עם גביעים, שתי המהלומות ואת הכדים של הפרסביטרי מיוחסים סילביו קוזיני וג 'ובאני אנג' לו Montorsoli. כל הקישוטים הקיימים מיוחסים לשיפוץ מהמאה השש עשרה. בקמרון הספינה הראשית נמצא הנס של הדרקון האתיופי מאת לוקה קמביאסו וייעודו של סן מטאו מאת ג ' ובאני בטיסטה קסטלו. על המזבח מימין למייג ' ור מוצג ציור של המשפחה הקדושה עם אן הקדושה על ידי ברנרדו קסטלו, מהמאה השש עשרה; משמאל, ישו בין הקדושים והתורמים על ידי אנדריאה סמינו. על קירות הכנסייה נמצאות קשתות השיש של הקדושים פלגיוס ומקסימוס, פטרונים של נוביגרד באיסטריה, ששרידיהם הועברו לגנואה על ידי ספינולה גספרה ב-1381. תחת המזבח שמור חרב השייכת ל "אבי המולדת" אנדריאה דוריה, שניתנה לו על פי המסורת של האפיפיור פאולוס השלישי. בגומחה בספינה נמצא ישו בקבר, פסל עץ פוליאכרום של אנטון מריה מרגליאנו, בעוד הפסלים בנישות האפסה (רחמים, בהשראת מיכלאנג ' לו, דוד, ירמיהו, יוחנן המטביל, וסנט אנדרו) הם עבודתם של מונטורסולי, שגם בקריפטה מתחת למקהלה, עם הזמן בסטוקו המוזהב, שאליו ניגש שיש, שבו שוכן קברו של אנדריאה דוריה, גם עבודתו של אותו אמן.
