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O verdadeiro centro inicial do franciscanismo, a Porziuncola tornou - se um dos locais de peregrinação mais importantes, tanto que o Papa piedoso V, no final do Concílio de Trento, decidiu construir esta grandiosa Basílica com o objetivo de dar nova vida à Ordem dos Frades Menores e uma recepção adequada aos muitos fiéis que já estavam visitando a Porziuncola. A igreja tem três corredores, com um transepto não saliente, plano de cúpula cruzada e uma abside semicircular, foram projetados por Galeazzo Alessi; foi concluído em 1679 com a construção da torre sineira à direita, que deveria ter correspondido à esquerda, que termina logo acima do telhado da Igreja .
Os terremotos de 1832 causaram o colapso da nave central até a abóbada transversal, seções das laterais e a parte superior da fachada, enquanto a cúpula e a abside foram salvas. O foco da Basílica, ou seja, a Capela da Porziuncola aparece como uma pequena igreja, diretamente sob a cúpula. No início do século XIII, A Igreja havia sido abandonada entre os carvalhos pertencentes aos monges beneditinos de Subasio. Por volta de 1205, Francisco estabeleceu sua casa lá, restaurou a igreja e fundou a Ordem Franciscana. As primeiras cabanas para os monges feitas de argila e juncos foram construídas em torno da Porziuncola. Este foi o lugar onde São Francisco viveu com mais frequência, onde deu a Santa Clara seu hábito religioso (1212) e onde ocupou o capítulo de Mats (1221), que contou com a presença de mais de 5.000 Frades. A tradição afirma que aqui São Francisco obteve indulgência plenária da Virgem Maria. A Porziuncola é uma construção retangular muito simples, feita de pedra policromada de Subasio. A parte superior da fachada é coberta por um afresco (o perdão de Assis), de Friedrich Overbeck de Lübeck (1829). No lado direito estão os restos de dois afrescos do século XV com influência sienesa: Madonna e Child entre São Francisco e São Bernardino. Na parte traseira, há um afresco de Perugino, Calvário (cuja parte superior foi perdida). O interior (as batentes das portas são do século XV) tem uma abóbada com nervuras cruzadas, um pouco enegrecida pela fumaça das lâmpadas; no altar, A Anunciação e histórias de perdão, um grande painel de Ilario Da Viterbo (1393), que também fez a tira com afrescos na abóbada com os evangelistas; na parede esquerda está um afresco da Imago Pietatis.
