Dinàstic de la biblioteca, recull la col·lecció de la biblioteca de la Estensi, els primers vestigis daten del segle XIV. En l'impuls del marquès Niccolò III va assumir el caràcter d'una important biblioteca d'humanitats, rica en obres de contingut literari, artístic i històric, i el seu pressupost va créixer de manera significativa en el període de l'humanisme i del renaixement manuscrits, valuós i fonamental edicions a la impressió, gràcies a la seva refinada i cura de la vocació a la col·leccionistes de la família ducal dels Este. En 1598, la biblioteca seguit la dinastia en el trasllat de la capital des de Ferrara a Mòdena.
En els segles següents, la Biblioteca Estense continuat ser enriquida per les obres de caràcter local i internacional, dels fons derivats de la supressió de les ordres religioses i llegats rebuts per les adquisicions i també a causa de l'il·lustrat activitat del famós bibliotecaris com ara Ludovico Antonio Muratori i Girolamo Tiraboschi. Després de la unificació d'Itàlia, la Biblioteca Estense es va fusionar amb la Biblioteca de la Universitat, que va portar a una important col·lecció de fons filosòfic, jurídic i textos científics: així va néixer el Estense Biblioteca de la Universitat, a dia d'avui un modern Institut d'interès nacional.