Historien om Lazise begynder i forhistorisk tid. Fund af pælebyggerbyer langs søens bredder og i landsbyen Pacengo (lokalitet Bor) dateres tilbage til slutningen af 1800-tallet og vidner om en menneskelig bosættelse langt tilbage i tiden.Der findes ingen sikre oplysninger om den romerske periode, men landsbyens beliggenhed og de forskellige vidnesbyrd, der er fundet i nabokommunerne, giver anledning til at formode, at der var en tilstedeværelse i området allerede i denne periode.De første dokumenter, der bekræfter eksistensen af et vigtigt søsamfund, går tilbage til den tidlige middelalder: Der er tale om nogle kanoniske diplomer, der omtaler jord, der er doneret til klosteret San Zeno i Verona, som ligger mellem Lazise og Colà, og et kejserligt diplom, underskrevet af Otto II (983), der giver indbyggerne i Lazise ret til handel, ripatica (en afgift for brug af floders eller søers bredder til fortøjning af både eller landgang, som var i brug i middelalderen) og fiskeri, men frem for alt fuldstændig borgerlig autonomi. Dette gjorde Lazise til den første kommune i Italien sammen med Bingen i Tyskland.Opførelsen af den første forsvarsring kan spores tilbage til denne periode, og det eneste bevis herpå er klokketårnet (i dag et privat begravelseskapel), der blev opført på den nuværende kirkegård. I 1077 bevilgede en anden kejser - Henrik IV - opførelsen af borgen og den fuldstændige befæstning af landsbyen med en mur: et forsvarssystem, der skulle blive udvidet og restaureret af Scaligeri (se plakaten på den borgerlige port, der er kendt som Porta civica di Cansignorio) og senere af Visconti, da kommunen blev en del af Gardesana (kendt i den venetianske periode som Acqua), en slags protektorat, der omfattede andre kommuner ved søen som Malcesine, Torri del Benaco og Garda .I 1405, efter krigen om erobring af Veronesisk territorium mellem Venedig og Carraresi, fulgte Lazise Veronas skæbne og overgav sig efter en kort konflikt til Serenissima, som gjorde byen til et primært center for trafik og kontrol af søen.Fra renæssancetiden stammer den nu forsvundne tezone til fremstilling af salpeter og toldhuset, der stadig er synligt ved siden af den gamle havn og centrum for indsamling og handel for hele den nedre del af søen. Netop på grund af sin handelsmæssige betydning befandt Lazise sig i centrum af sammenstødene mellem Serenissima og Ligaen af Cambray (1509), da venetianerne sænkede nogle skibe fra den militære flåde foran byens havn. Den blev senere plyndret af Lansqueneterne, der kom ned i forbindelse med krigen mellem Karl V og Frans I om hertugdømmet Milano.Først i det 17. århundrede begyndte en periode med ro og fred, som gavnede den økonomiske og sociale vækst i Lazise: de gamle fiskeri- og flodprivilegier blev genindført, der blev oprettet en vagt til at kontrollere told og handel mod smugleri, og veronesiske adelsslægter byggede villaer og gårde inde i landet. Med franskmændenes indtog i Italien og krigen mod Venedig blev Lazise besat af Napoleons tropper, som oprettede en militærkommando. Senere, med Campoformio-traktaten, befandt Lazise sig på grænsen mellem de to imperier (Østrig og Frankrig), og blev senere annekteret først til Kongeriget Italien (1805) og derefter, med restaurationen, til Kongeriget Lombardo-Veneto (1815).Den sunkne galeje.Under kampene mellem Cambrai-forbundet og Serenissima var Gardasøen skueplads for talrige søslagsmål. Især i 1509 beordrede De Ti Råd i lyset af den vanskelige situation den daværende kaptajn Zacharia Loredan til at overlade Lazise til fjendens hænder, ikke før han havde ødelagt det, der var tilbage af den nuværende militærflåde.Kaptajnen dekreterede, at galejen og de to resterende fuste skulle tages ud for Lazise og brændes. Først i 1962 lykkedes det takket være en gruppe dykkere at finde frem til den korrekte position af de nedsænkede skibe og at bjærge dem. Allerede i nogen tid havde man i bundreonerne (bundtrawlnet) fundet strukturer eller materiale, der tilhørte skibene, og stumme beviser på deres eksistens.Dykkerholdet under ledelse af professor Zorzi arbejdede i fem år på at rense og undersøge det eneste tilbageværende skib (kabyssen), som viste sig at være 30 meter langt og 6 meter bredt med en sejlmast og lå ca. 100 meter fra den gamle havnemunding.Bådens to ankre blev også fundet, og der blev fundet andet sejlmateriale. Desværre er der ingen spor af den meget berygtede landsbyskat, som den skulle have transporteret, men det er mere en lokal legende end en historisk kendsgerning.I årevis har man ventet på en endelig bjærgning af den resterende struktur og dens musealisering i det gamle toldhus, som det altid har været foreslået. Men i øjeblikket forbliver den gamle venetianske galeje af både økonomiske og bevaringsmæssige årsager (man frygter, at en udstilling under åben himmel vil kunne skade en stor del af genstanden) på sin plads på bunden af søen. Under den første og anden uafhængighedskrig befandt Lazise sig i centrum af en række episoder, da det på grund af sin nærhed til Peschiera - dengang en østrigsk fæstningsby - i 1866 blev optaget i Kongeriget Italien ved folkeafstemning. De historiske begivenheder fra da af er meget mere rolige. Interessant er den forandring, der begyndte i begyndelsen af det 20. århundrede, og som førte til, at kommunen blev et vigtigt turistcentrum.