Krypta původního hříchu byla místem uctívání Benediktinské jeskyně Lombardského období. Je ozdoben cyklus fresek ze dne mezi VIII. a IX. století, tažený umělec známý jako malíř květin Matera a vyjádření historické charakteristiky Benediktinského-Benevento umění. Levá stěna je oživena třemi výklenky, na kterých jsou zobrazeny Triarchie apoštolů, Panenské královny a archandělů. Zadní stěna je naopak oživena velkým obrazovým cyklem zobrazujícím epizody stvoření a původní hřích.