Le 31 mai 2009, le nouveau musée archéologique a été ouvert au public dans l'église basilique de San Lorenzo et dans la chapelle Meli du XVe siècle qui lui est attenante. Il constitue le développement de l'ancienne Section Archéologique du Musée Civique, fermée depuis la fin des années 90 pour permettre la restauration de certains types de matériaux - en particulier les mosaïques - et complète l'exposition, toujours au Palazzo Affaitati, des collections de formation "historique" ; non territoriale, à partir de l'héritage du Marquis Ala Ponzone.
L'église de San Lorenzo, déconsacrée à la fin du XVIIIe siècle, avec un plan basilical à trois nefs, date de la fin du XIIe - début du XIIIe siècle et présente les caractéristiques particulières de l'architecture romane.
Les fouilles menées depuis 1962 ont mis au jour les restes d'une église antérieure, identifiable à celle mentionnée par un parchemin de 990, d'un bâtiment de cimetière paléochrétien et d'une nécropole romaine du premier siècle avant J.-C., située sur le premier tronçon suburbain, vers l'est, de l'ancienne Via Postumia.
L'utilisation du complexe monumental comme musée, lui-même un site archéologique, a favorisé sa récupération complète, tant du point de vue structurel que décoratif, même s'il est encore préservé.
Actuellement, il abrite ce que l'on peut considérer comme le cœur des collections archéologiques de Crémone : grâce aux trouvailles faites depuis le XIXe siècle jusqu'aux récentes fouilles de la place Marconi, l'image de la ville fondée par les Romains en 218 avant J.-C., la première au nord du Pô, est restaurée.