Le musée, créé en 1945, est situé sur la Piazza del Duomo, à l'intérieur de l'ancienne église de Jésus, et contient divers objets et œuvres d'art provenant des églises de la région appartenant au diocèse. La collection d'art a été fondée en 1945 et contient des œuvres importantes de Pietro Lorenzetti, Beato Angelico, Bartolomeo della Gatta, Sassetta et Luca Signorelli, ainsi que du mobilier sacré de grande valeur. L'exposition commence par le seul objet ancien présent, de très grande qualité, le sarcophage romain avec le Combat entre Dionysos et les Amazones, datable du deuxième siècle après J.-C. et trouvé près du Duomo. La raffinée "Annonciation de Beato Angelico" et parmi les œuvres du Maestro Luca Signorelli, il convient de souligner la "Lamentation du Christ mort" peinte en 1502 pour le maître-autel de l'église de Santa Margherita, une œuvre d'une grande force plastique et aux couleurs vives.
Une autre œuvre prestigieuse est la splendide Assunta che porge la cintola a San Tommaso de Bartolomeo della Gatta, datée du début des années 1570.