בזיליקת המקלט מסנט אלפונסו הכנסייה הייתה מבוקשת ותוכננה על ידי סנטלפונסו עצמו, שהפקיד בידיו את הפרויקט ואת כיוון העבודה בידי האדריכל המלכותי פייטרו סימפונטה. הבנייה, שהחלה בשנת 1756, הושלמה לאחר מספר הפרעות רק בשנת 1824. בשנת 1908 הועלתה הכנסייה לבזיליקה אפיפיורית על ידי האפיפיור פיוס X. בפנים, עם צלב לטיני, יש ספינה אחת עם 4 קפלות בצד המוקדשות לסיינט ג 'רארדו מאיאלה, סיינט קלמנט מ' הופבאוור, סנט ג ' וזף, וגבירתנו של מחרוזת התפילה. החזית בסגנון נאו-קלאסי, עם קישוטי שטוקו וטורים, נעשתה בשנת 1823 על ידי פיליפו קונפורטו. בשנת 1824, קרמיין קאלבאן הוציא להורג, במקום זאת, פסלי הקדושים פיטר ופול, הוצבו בשתי גומחות בצידי הכניסה.
