Le Musée juif de Gênes, inauguré en 2004 sur un projet de Gianfranco Franchini, est situé au dernier étage de cette synagogue qui a vu l'histoire des Juifs génois de 1835 à nos jours. Il conserve les œuvres de la collection "viaggio nel mondo ebraico" ; d'Emanuele Luzzati, donnée par l'artiste à la Communauté juive de Gênes. La collection est exposée au public en alternance avec des expositions documentaires artistiques, religieuses ou historiques, mises en place à l'occasion d'événements institutionnels tels que le Memorial Day et la Journée européenne de la culture juive. Les visites guidées sont organisées sur rendez-vous avec une attention particulière pour les groupes scolaires ; pour les écoliers, en plus des visites, il y a des leçons thématiques tenues par un personnel spécialisé et bénévole avec l'intention, conformément aux objectifs du Musée, de faire connaître au public la culture juive et les étapes de l'histoire du judaïsme ligure et italien.
