Kurz nach dem Bau der Villa Cerreto Guidi Medici im Jahr 1573 kaufte einer der Söhne von Cosimo I., Ferdinando, eine weitere Residenz in dieser Gegend und renovierte sie: die Villa Ambrogiana Medici, die direkt auf den Arno in der Nähe von Montelupo Fiorentino blickt.
Die vier robusten quadratischen Türme prägen das Äußere der Villa und machen sie zu einer der monumentalsten unter den Bauten der Medici-Familie. Die Ambrogiana war die gewählte Residenz von Cosimo III., der zu Beginn des 18. Jahrhunderts einen Teil seiner Gemäldesammlung hierher verlegte und den Bau des nahe gelegenen, dem Heiligen Petrus von Alcantara geweihten Klosters in Auftrag gab.
Der Park der Villa, der sich bis zum Kiesbett des Flusses erstreckt, bot eine spektakuläre manieristische Grotte mit Wasserspielen, ähnlich denen, die Buontalenti in den Boboli-Gärten in Florenz und in vielen anderen Adelsresidenzen des späten 16.
Heute ist die Villa eine Einrichtung des Gesundheitswesens und kann bei seltenen Gelegenheiten in Begleitung eines Führers besichtigt werden.