La historia de la Iglesia de Nuestra Señora del Puente está estrechamente ligada al puente, o más bien a los puentes sobre los que se construye.
La construcción en el puente conocido como Puente de Diocleciano del primer oratorio -primero dedicado a Nuestra Señora del Puente y luego a Nuestra Señora de las Gracias- por parte de los ciudadanos en 1389, fue necesaria para custodiar una antigua estatua encontrada en los vanos del puente tras el terremoto de 1088. La tradición, que no ha sido confirmada, dice que la estatua de la Virgen con el Niño era del siglo VIII y de factura bizantina, y que había sido escondida en el puente para salvarla de la furia iconoclasta que se desató en aquellos años.Más probable es que, como relata el historiador Antinori, la antigua capilla sólo contenía una imagen pintada de la Virgen, y que la actual escultura de terracota data de finales del siglo XIV. El primer oratorio, que se encontraba junto a la actual capilla del Santísimo Sacramento, contenía la estatuilla de la Virgen flanqueada por las figuras de los doce apóstoles. Fue precisamente esta colocación, entre figuras de cuerpo entero, la que motivó la realización del artefacto mariano, originalmente de medio cuerpo. Las sucesivas ampliaciones del oratorio, necesarias debido al creciente número de fieles que se dirigían a Nuestra Señora del Puente y obtenían de ella copiosas gracias, condujeron en etapas posteriores a la construcción de la Basílica en su forma actual, que tuvo lugar a finales del siglo XVIII, diseñada por el arquitecto Eugenio Micchitelli, tras la demolición de otro edificio de culto, la iglesia de la Santissima Annunziata, primera catedral de la ciudad tras la erección de Lanciano primero como sede episcopal (1515) y luego como arzobispado (1562).
La fachada, cuyas obras se iniciaron en 1819, nunca se terminó. Tiene una parte delantera que consiste en un pórtico de tres luces con columnas rematadas por la balaustrada de una terraza. Su mampostería es de ladrillo visto, y es uno de los mejores ejemplos de la aplicación de la terracota al orden arquitectónico.
El imponente campanario de cuatro pisos (incluido el que ahora está enterrado debido a la elevación y nivelación de la plaza) fue construido entre 1610 y 1640 por Tommaso Sotardo de Milán. Las obras de consolidación de la estructura se llevaron a cabo en 1942-43 y, más recientemente, en el período comprendido entre 1985 y 1996, durante el cierre tras un terremoto.
